Naxçıvan Turizm İnformasiya Mərkəzi Naxçıvan Muxtar Respublikası Ali Məclisi Sədrinin 2006-cı il 15 may tarixli Fərmanı ilə Naxçıvan Muxtar Respublikası Mədəniyyət və Turizm Nazirliyinin strukturuna daxil edilmişdir. Naxçıvan Muxtar Respublikası Nazirlər Kabinetinin 2018-ci il 26 oktyabr tarixli 177 nömrəli qərarı ilə Naxçıvan Muxtar Respublikasının Turizm Departamentinin tabeliyinə verilmişdir.
